明朝中后期，台湾的命运在历史的洪流中悄然改变。当时的台湾，对于大陆来说，还是一个相对陌生的地方。虽然早在三国时期，孙权就曾派人前往“夷洲”（即台湾），但那时的接触更多是短暂的、象征性的。到了明朝，台湾的地位依然模糊，既不是朝廷的重点关注对象，也没有明确的行政归属。
随着时间的推移，尤其是明朝中后期，东南沿海的局势发生了变化。倭寇的侵扰、海盗的横行，使得沿海地区的居民生活不安定。与此同时，西方殖民势力也开始在亚洲扩张。葡萄牙人、西班牙人先后到达东南亚和东亚地区，他们的目标不仅仅是贸易，更是对土地和资源的控制。
在这样的背景下，荷兰人逐渐成为了台湾的主导力量。据一些记载，荷兰人在17世纪初就已经开始在澎湖列岛建立据点，试图通过这些据点控制海上贸易路线。有人提到，荷兰人之所以选择台湾作为进一步扩张的基地，是因为他们发现这里的地理位置优越，既可以作为与中国大陆贸易的中转站，也可以作为对抗西班牙和葡萄牙势力的前哨。
1624年左右（具体时间有不同的说法），荷兰人正式占领了台湾南部地区。他们在台南建立了热兰遮城（Fort Zeelandia）和普罗民遮城（Provintia）等堡垒，作为统治中心。荷兰东印度公司在这里设立了行政机构，开始对当地的原住民进行征税和管理。据说荷兰人还引入了一些西方的农业技术和社会制度，试图将台湾打造成一个繁荣的殖民地。
荷兰人的统治并非一帆风顺。当时台湾的原住民部落众多且分散，他们对荷兰人的统治并不完全接受。据一些记载，原住民与荷兰人之间时有冲突发生。明朝政府虽然对台湾的关注不多（或者说有心无力），但也曾试图通过海盗或商人与荷兰人进行间接对抗。
有人提到（具体时间不详）明朝末年郑成功的事迹与台湾有着密切的关系。郑成功是明朝遗臣郑芝龙的儿子（一说郑芝龙是他的养父）他在东南沿海一带拥有强大的海上力量。1661年左右（具体时间有争议）郑成功率领大军渡海攻打荷兰人在台湾的据点热兰遮城经过长时间的围困最终迫使荷兰人投降结束了他们在台湾的统治并开始了对台湾的直接管理建立起了以明郑政权为基础的地方行政体系直到清朝康熙年间才被清军所灭
