基督教的历史长河中，异端的概念一直是一个复杂且多变的议题。所谓“异端”，通常指的是那些被主流教会认定为偏离正统教义的教派或思想。随着时间的推移，这些所谓的“异端”往往有着各自独特的历史背景和思想渊源。
早在公元2世纪，基督教会内部就开始出现对教义的不同理解。其中最为著名的异端之一是诺斯替主义（Gnosticism）。诺斯替主义者认为，物质世界是邪恶的，只有通过神秘的知识（gnosis）才能获得救赎。这与正统基督教主张的通过信仰和基督的牺牲来获得救赎的观点相悖。据一些记载，诺斯替主义者在当时的教会中颇具影响力，甚至有教会领袖被怀疑持有诺斯替思想。有人提到，正是为了对抗这种思想，早期教父如伊里奈乌斯（Irenaeus）等人才开始系统地阐述正统教义。
另一个广为人知的异端是阿里乌斯派（Arianism）。这一派别由亚历山大里亚的阿里乌斯（Arius）提出，主张耶稣基督并非与上帝同质，而是上帝创造的第一个受造物。这一观点在公元4世纪引发了广泛的争议，甚至在教会内部引发了分裂。据说，当时的皇帝君士坦丁大帝为了平息争议，召集了尼西亚会议（Council of Nicaea），最终确立了“三位一体”的正统教义。阿里乌斯派的信徒并未因此消失，他们在许多地方继续传播自己的信仰，直到数百年后才逐渐式微。
在中世纪，异端的概念变得更加复杂和严厉。教会不仅在教义上对异端进行打击，还在政治和社会层面进行压制。著名的清洁派（Catharism）就是这一时期的代表性异端之一。清洁派信徒认为物质世界是邪恶的，主张通过禁欲和纯洁的生活方式来追求灵魂的救赎。他们在法国南部和意大利北部地区有着广泛的影响力。有人提到，正是由于清洁派的强大影响力，教皇英诺森三世才发动了阿尔比十字军（Albigensian Crusade）来镇压这一异端。这场十字军战争持续了数十年之久，导致了大量的人员伤亡和社会动荡。
到了宗教改革时期，异端的定义再次发生了变化。马丁·路德和约翰·加尔文等宗教改革家被天主教会视为异端分子，而他们自己则认为天主教会才是真正的异端。这一时期的异端问题不仅涉及教义的分歧，还牵涉到政治权力的争夺和社会结构的变革。据说路德在提出《九十五条论纲》时并未预料到会引发如此巨大的反响，而加尔文则在日内瓦建立了一个严格的新教神权国家。这些改革者的思想在后来的几个世纪中不断传播和发展，形成了今天我们所知的新教各派别。
即使在现代社会中，关于何为正统、何为异端的争论依然存在。例如在20世纪初兴起的耶和华见证人（Jehovah's Witnesses）就被许多主流教会视为异端组织。他们拒绝接受传统的三位一体教义和国家权威的神圣性等观点引发了广泛的争议和抵制活动事件经过展开
